Название реки связано с древнем племенем баргутов. Либо название племени образовано от более древнего названия реки, либо, наоборот, название реки образовано от названия племени. При переводе «барга-жан» означает «жители глуши, окраины».
Долина реки удобна для поселений. Здесь издавна проживали люди; сначала это были племена эвенков, потом долину населили преимущественно буряты.
В бурятском языке название долины звучит как «Баргуджин-Токум».