Баргузинский заповедник является старейшим заповедником России. Он основан 29 декабря 1916 года (по старому стилю).
Образован он был прежде всего с целью охраны соболя. В настоящее время заповедник является комплексным — на его территории охраняются и изучаются все природные объекты: животные, растения, сообщества организмов, природные комплексы.
Контора заповедника находится в посёлке Давша. В сентябре 2011 года на базе Баргузинского заповедника и Забайкальского национального парка Федерального образовано государственное бюджетное учреждение «Объединённая дирекция Баргузинского заповедника и Забайкальского национального парка».