Музей находится в здании, где с 1961 до 1989 годы располагался Лимнологический институт СО РАН (последний сейчас находится в Иркутске).
С 1993 года Байкальский музей стал самостоятельным учреждением.
Байкал и Прибайкалье. Природа Байкала. 2007.